MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 141504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	CGT	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005296	CGG	3	9	144	152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005296	TGG	2	6	162	167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005296	TTCG	2	8	246	253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005296	ACG	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005296	GTTTT	2	10	327	336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005296	CG	3	6	350	355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005296	GCG	2	6	361	366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005296	ATC	2	6	419	424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005296	TCC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_005296	GCTGA	2	10	510	519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_005296	TC	3	6	530	535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005296	GCT	2	6	557	562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005296	GCG	2	6	572	577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005296	AACTC	2	10	590	599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_005296	CGC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005296	GCT	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005296	CG	3	6	765	770	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
19	NC_005296	ACG	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
20	NC_005296	ACT	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933081
21	NC_005296	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
22	NC_005296	CGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
23	NC_005296	CGTC	2	8	994	1001	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
24	NC_005296	GCA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
25	NC_005296	CGG	2	6	1053	1058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
26	NC_005296	CGC	2	6	1061	1066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
27	NC_005296	CGC	3	9	1125	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
28	NC_005296	GCC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
29	NC_005296	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933081
30	NC_005296	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
31	NC_005296	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
32	NC_005296	TCG	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
33	NC_005296	CTCG	2	8	1332	1339	0 %	25 %	25 %	50 %	39933081
34	NC_005296	CGA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
35	NC_005296	ACC	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933081
36	NC_005296	GCCG	2	8	1453	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
37	NC_005296	GTG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
38	NC_005296	CGC	2	6	1473	1478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
39	NC_005296	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
40	NC_005296	CGA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933081
41	NC_005296	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933081
42	NC_005296	CG	3	6	1598	1603	0 %	0 %	50 %	50 %	39933081
43	NC_005296	CACC	2	8	1617	1624	25 %	0 %	0 %	75 %	39933081
44	NC_005296	CTG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
45	NC_005296	CTG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
46	NC_005296	TCG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
47	NC_005296	GACGCT	2	12	1938	1949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933081
48	NC_005296	GCC	2	6	1970	1975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933081
49	NC_005296	ACCAC	2	10	1991	2000	40 %	0 %	0 %	60 %	39933081
50	NC_005296	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933081
51	NC_005296	TCC	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_005296	CAT	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005296	TCA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005296	CG	3	6	2350	2355	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
55	NC_005296	CGAC	2	8	2468	2475	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
56	NC_005296	GCCG	2	8	2502	2509	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
57	NC_005296	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
58	NC_005296	GCCG	2	8	2635	2642	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
59	NC_005296	CGC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
60	NC_005296	GATC	2	8	2748	2755	25 %	25 %	25 %	25 %	39933082
61	NC_005296	CTA	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933082
62	NC_005296	CCG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
63	NC_005296	GC	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
64	NC_005296	CGAC	2	8	2858	2865	25 %	0 %	25 %	50 %	39933082
65	NC_005296	GCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933082
66	NC_005296	CGT	2	6	3036	3041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
67	NC_005296	AAC	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933082
68	NC_005296	CTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933082
69	NC_005296	AAG	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
70	NC_005296	CGA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933082
71	NC_005296	CCG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933082
72	NC_005296	GAA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933082
73	NC_005296	GC	3	6	3416	3421	0 %	0 %	50 %	50 %	39933082
74	NC_005296	AGGCG	2	10	3449	3458	20 %	0 %	60 %	20 %	39933082
75	NC_005296	GAT	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005296	ATCC	2	8	3522	3529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_005296	GGA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005296	CGT	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
79	NC_005296	CCG	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
80	NC_005296	CTGACG	2	12	3718	3729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933083
81	NC_005296	CCG	2	6	3767	3772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
82	NC_005296	GGT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
83	NC_005296	GCG	2	6	3858	3863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
84	NC_005296	GC	3	6	3932	3937	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
85	NC_005296	GCC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
86	NC_005296	GCG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
87	NC_005296	ACC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933083
88	NC_005296	ACG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
89	NC_005296	CGG	3	9	4031	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933083
90	NC_005296	CTG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
91	NC_005296	GCAGC	2	10	4291	4300	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
92	NC_005296	CGC	2	6	4323	4328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
93	NC_005296	TCCG	2	8	4362	4369	0 %	25 %	25 %	50 %	39933083
94	NC_005296	TGGA	2	8	4390	4397	25 %	25 %	50 %	0 %	39933083
95	NC_005296	GACGC	2	10	4469	4478	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
96	NC_005296	CGC	3	9	4476	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
97	NC_005296	GC	3	6	4552	4557	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
98	NC_005296	GCT	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
99	NC_005296	TCG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
100	NC_005296	CGC	2	6	4643	4648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933083
101	NC_005296	TGC	3	9	4649	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933083
102	NC_005296	CGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933083
103	NC_005296	GTG	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933083
104	NC_005296	GTT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933083
105	NC_005296	GC	3	6	4727	4732	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
106	NC_005296	CG	3	6	4823	4828	0 %	0 %	50 %	50 %	39933083
107	NC_005296	GCCG	2	8	4852	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_005296	GGC	2	6	4863	4868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_005296	GCC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_005296	TCTA	2	8	4925	4932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_005296	GAC	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005296	AAG	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005296	GCCG	2	8	5097	5104	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
114	NC_005296	CGA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
115	NC_005296	CAC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
116	NC_005296	GTC	2	6	5221	5226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
117	NC_005296	CGA	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
118	NC_005296	GGCC	2	8	5250	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
119	NC_005296	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
120	NC_005296	GT	3	6	5354	5359	0 %	50 %	50 %	0 %	39933084
121	NC_005296	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
122	NC_005296	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
123	NC_005296	CGG	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
124	NC_005296	GGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
125	NC_005296	CGGCGT	2	12	5442	5453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	39933084
126	NC_005296	GGT	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
127	NC_005296	TGC	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
128	NC_005296	CAC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933084
129	NC_005296	GTC	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
130	NC_005296	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
131	NC_005296	CAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
132	NC_005296	GGT	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
133	NC_005296	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
134	NC_005296	GTGCT	2	10	5896	5905	0 %	40 %	40 %	20 %	39933084
135	NC_005296	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933084
136	NC_005296	CGG	2	6	5931	5936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
137	NC_005296	CCGCG	2	10	5955	5964	0 %	0 %	40 %	60 %	39933084
138	NC_005296	AAG	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933084
139	NC_005296	CGA	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
140	NC_005296	CCG	2	6	6053	6058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
141	NC_005296	CCCGA	2	10	6076	6085	20 %	0 %	20 %	60 %	39933084
142	NC_005296	TCG	2	6	6091	6096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
143	NC_005296	GGT	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
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145	NC_005296	TCCG	2	8	6186	6193	0 %	25 %	25 %	50 %	39933084
146	NC_005296	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933084
147	NC_005296	GCC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933084
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149	NC_005296	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	39933084
150	NC_005296	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
151	NC_005296	GGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933084
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153	NC_005296	ATC	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933084
154	NC_005296	TGA	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933084
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157	NC_005296	GCT	3	9	6618	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933084
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162	NC_005296	CGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
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172	NC_005296	CGA	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
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181	NC_005296	CGA	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933084
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185	NC_005296	TCG	2	6	7579	7584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_005296	GAC	2	6	10897	10902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933088
272	NC_005296	GAT	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933088
273	NC_005296	GCG	2	6	11030	11035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933088
274	NC_005296	CTT	2	6	11037	11042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933088
275	NC_005296	GATC	2	8	11045	11052	25 %	25 %	25 %	25 %	39933088
276	NC_005296	TCT	2	6	11093	11098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933088
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279	NC_005296	TCG	2	6	11174	11179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933088
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281	NC_005296	CGCT	2	8	11245	11252	0 %	25 %	25 %	50 %	39933089
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305	NC_005296	CGC	2	6	12122	12127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933089
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402	NC_005296	GC	3	6	15702	15707	0 %	0 %	50 %	50 %	39933093
403	NC_005296	TGA	2	6	15717	15722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933093
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491	NC_005296	GC	3	6	19000	19005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_005296	GCCG	2	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	39933096
498	NC_005296	GGTCG	2	10	19281	19290	0 %	20 %	60 %	20 %	39933096
499	NC_005296	CGAA	3	12	19304	19315	50 %	0 %	25 %	25 %	39933096
500	NC_005296	TCG	2	6	19392	19397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933096

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